肝肾阳虚主要是指肾阳不足所致的虚寒证，肝肾阴虚是指肝肾阴液不足所致的虚热证。肝肾阳虚和阴虚的区别还在于病因、症状和治疗重点的不同，比如肝肾阳虚者主要是因为先天体寒、年老肾虚、房事过度等原因，而肝肾阴虚者主要是因为身患慢性疾病或温热病。
1、病因不同
肝肾阴虚多发于形体消瘦者，是很多疾病后期的阶段，主要是由于长期患病、过度劳累，或者身患温热病导致热邪耗伤阴液，常常是肾阴亏虚继而导致肝阴不足。肝肾阳虚者以肾阳虚为主，肾阳虚主要由于先天虚寒体质，或年老体弱、长期患病以及房事过度等因素伤及肾阳所引起;肝阳虚则主要是由于肝脏阳气不足导致阴寒内盛等原因所致。
2、症状不同
肝肾阴虚常表现为头晕目眩、眼睛干涩、易疲劳、肝区隐痛、腰膝酸痛、遗精、耳鸣等症状。肾阳虚主要表现为腰膝酸软、男性阳痿早泄、女性宫寒、腹泻夹有不消化食物、小便频繁清长、夜尿增多、浮肿等症状;肝阳虚主要表现为萎靡不振、易疲劳、脾气暴躁、腹痛、腰痛等症状。
3、治疗不同
肝肾阴虚的治疗以滋阴益肾为主要原则，常用杞菊地黄丸、知柏地黄丸、归芍地黄丸等中药。肾阳虚的治疗以温肾补阳为原则，常用金匮肾气丸、右归丸、桂附地黄丸等;肝阳虚的治疗需要辨明病机，肝气郁者常用逍遥丸、柴胡舒肝散等中药，肝阳不足者常用暖肝煎、吴茱萸汤等中药。
