双歧杆菌能治便秘，但治疗效果是因人而异的。轻症便秘患者可以通过口服双歧杆菌微生态制剂来改善肠道环境、促进肠胃蠕动，肠内菌群易失调的老年人也可以适量使用双歧杆菌产品。但如果患者便秘程度较重，只靠补充双歧杆菌是不够的。
双歧杆菌是一种重要的肠内有益微生物，具有调节肠道菌群比例、改善胃肠道功能、提高机体免疫力等功效，在临床上多用于治疗儿童急慢性腹泻以及因过量使用抗菌药而导致的抗生素相关性腹泻，对便秘、腹胀等症状也有一定的缓解作用，但具体效果存在较大的个性化差异。
如果患者便秘的程度较轻，持续时间也比较短，使用双歧杆菌产品的效果相对较好，它可以与肠道内的乳酸菌等有益菌共同促进肠道对矿物质的吸收，产生醋酸、乳酸、丙酸和丁酸等有机酸来刺激肠道蠕动、净化肠内环境，对功能性便秘有显著效果。
如果患者便秘的程度较重，排便频率极低，比如每周一次，双歧杆菌的治疗效果是非常小的，病人必须在专业医生的指导下使用促胃动力药或其它药物。另外，老年人肠道菌群中的双歧杆菌数量明显下降，口服双歧杆菌制剂可以有效改善因缺乏双歧杆菌而引发的便秘。
