回肠末端溃疡是很难自愈的，由于此处分布着大量细菌，溃疡面很容易发生感染，患者应该尽早通过药物治疗、改善饮食和生活习惯等方法来控制病情，以免引起严重并发症。另外，回肠末端溃疡也有一定可能是克罗恩病，容易反复发作，需要积极配合治疗。
回肠连接着空肠和盲肠，在胆汁酸的肝肠循环中起着重要作用，其末端接续大肠，含有大量细菌和丰富的淋巴结。回肠末端溃疡往往与不良饮食和生活习惯有关，自愈的可能性非常小，如果不及时采取治疗措施，回肠末端的各种细菌可侵入溃疡面，引发严重感染。
回肠末端溃疡和克罗恩病有一定的联系，克罗恩病属于慢性炎性肉芽肿性疾病，其病灶多为肠道溃疡，且好发于回肠末端和邻近结肠，需要将之与单纯的回肠末端溃疡仔细鉴别。
如果患者不引起重视，任由回肠末端溃疡发展，可出现肠梗阻、腹腔内脓肿、胆结石等并发症，部分直肠和结肠黏膜受累者甚至会出现癌变。回肠末端溃疡的主要治疗方法为药物治疗，同时注意改善饮食，培养健康的作息习惯，必要时可行手术治疗。
