小肠间质瘤的大部分患者在手术后两年内会出现腹腔内、局部或转移复发。在临床上，小肠间质瘤术后复发的患者会出现腹痛的症状，有一部分患者甚至还会出现腹胀、便血的症状。随着疾病的发展，部分患者还会出现乏力、消瘦等不适症状。
目前胃肠道间质瘤的治疗方法主要是手术治疗和分子靶向治疗，而手术治疗目前是唯一有治愈可能的治疗手段。肿瘤的完整切除是影响患者生存时间一个很重要的因素，完全切除术患者的生存时间明显高于不完全切除术患者的生存时间。肿瘤的完整切除取决于很多因素，比如肿瘤大小、有无远处转移或腹腔内种植、是否浸润四周组织及器官等。
长期随访表明，虽然超过50%的胃肠道间质瘤可以完整切除肿瘤，腹腔内局部复发及远处转移率仍很高。首次完整切除肿瘤的患者，在结束长为18个月的中位随访时间后，有90%的患者出现腹腔内、局部或转移复发，大多在术后2年内出现。
在临床上，小肠间质瘤术后复发的患者会出现腹痛的症状，有一部分患者甚至还会出现腹胀、便血的症状，随着病情的进展，如果患者的病情比较严重，患者还会出现消瘦、乏力、食欲不振，有的患者还会出现发热的症状。
