益肝灵片是一种保肝药，只要不超过治疗剂量，其毒副作用是比较小的，少数患者服用益肝灵后出现恶心、头晕和腹泻等不良反应。由于妊娠妇女使用此药的安全性暂未确立，因此需慎用此药;另外，心脏病和过敏体质者也需慎用。
益肝灵片的有效成分为水飞蓟宾，进入人体后可转化为其它代谢物排出，大部分以原型排出，这种化学物质的毒性很小，在药理实验中不良反应轻微而少见。用于临床治疗中，按照正确的用量，目前也未见有明显的不良毒副作用报道，偶有少数患者出现恶心、头晕和腹泻等不良反应。
益肝灵片适用于急慢性肝炎、脂肪肝、酒精肝和早期肝硬化等肝病的辅助治疗，可以起到一定的护肝作用，但部分患者却需慎重用药。对于妊娠妇女来说，由于使用此药的安全性暂未确立，因此需要在医生严格指导下权衡利弊后再决定是否使用此药。而对于心脏病、过敏体质者以及肝肾功能严重损伤者，其对于药物的耐受性均较低，需要慎用此药，以免造成严重的毒副作用。
虽然益肝灵片具有保护肝功能的作用，副作用较小，但仍然是一种药物，因此不可以随意使用。对于无病的正常人来说，更不可以作为养生保健品来服用。因为水飞蓟宾这种化学物质的药理作用仍需要进一步研究，益肝灵片的毒理作用也没有完全明确。
