胆汁淤积的治疗取决于病因及病情严重程度。肝炎引起的胆汁淤积可采用抗病毒治疗和药物治疗等措施，必要时可考虑肝脏移植手术;胆道梗阻引起的胆汁淤积通常需要采取手术干预;自身免疫性肝病患者需应用免疫抑制剂;妊娠胆汁淤积以改善肝功能为主。
严格来说，胆汁淤积并不是一种疾病，而是一种疾病体征，胆汁淤积的病因有很多，比如病毒性肝炎、酒精肝、胆总管结石、胰管癌、胰腺炎、胰腺假性囊肿等疾病，疾病类型不同，治疗方法和难度也有很大的差异。
对于病毒性、药物性以及酒精性肝炎等疾病引起的胆汁淤积，一般需采取药物治疗和营养支持治疗，比如服用甘草酸制剂、双环醇等抗炎保肝类药物，有明显纤维化或肝硬化表现的患者可以吃安洛化纤丸、复方鳖甲软肝片等抗纤维化药物，慢性乙型和丙型肝炎患者还应进行抗病毒治疗。如果患者的肝病进展到终末期，或者出现肝衰竭，可进行肝移植手术。
如果患者的胆汁淤积是由胆道梗阻引起的，比如胆管结石、胆道肿瘤等疾病，一般需要通过外科手术进行取石治疗或切除肿瘤。如果是原发性胆汁性肝硬化等自身免疫性肝病引起的，可以口服熊去氧胆酸来溶解胆结石中的胆固醇，同时应用泼尼松龙等免疫抑制剂。
如果患者为孕妇，也可能是妊娠胆汁淤积症，该病有一定的遗传倾向，孕妇需要改善肝功能，降低血清内的胆汁酸水平，由于药物对胎儿的生长发育有一定影响，在进行保肝治疗时，应加强对胎儿的监护，根据情况给予患者吸氧、补充维生素K等治疗。
