当前查幽门螺杆菌主要有两种方式。一种是在患者的胃部取出相应的标本做细菌立体培养，从而观察病菌的情况来判断患者的病情。第二种则是选用C14呼吸实验，这也是目前临床医学上较为常见的一种判断方法，其检查结果相较于第一种也更加准确。
对于幽门螺杆菌的检查方法来说，细菌培养方法在当前并不常见。一来是因为呼吸实验的方法要更加方便快捷。同时也因为细菌离体培养对于培养环境有着较高的要求，稍有不慎就可能会导致细菌死亡，从而不能够良好的观察病症，因此当前很少采用这一种方式来进行检查。
呼吸实验是当前主流的来判断患者是否患有幽门螺杆菌感染的一种技术，患者在进行检查前，需要首先吃一粒C14胶囊，医生随后通过专业的仪器来对患者所呼出的气体进行检验。一般dpm数值在100以下就证明其并没有被感染。
幽门螺杆菌的检查主要是通过呼出的气体进行检查，因此口气的改变尤为重要。但口气的改变也不全然是由于幽门螺杆菌感染所引起，还有可能是牙科疾病或是消化系统的疾病导致患者口气较重。
