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食物中毒非常典型的表现是急性胃肠道反应，主要就是表现为腹痛、腹胀、腹泻，就是常说的拉肚子等，患者还可能上吐下泻，属于积极性的消化系统反应。食物中毒还有可能是神经毒，可能不发生胃肠道反应，但也会有急性的身体反应。还有一些中毒会损害肝和肾，比方说吃了毒蘑菇以后，会导致中毒性的休克。
食物中毒还有一种是慢性中毒，很难立即发现，比方说吃发霉的食物导致黄曲霉菌毒素慢慢累积，会导致癌症。中国人大部分肝癌和胃癌发病率较高的情况，都可能跟食物慢性中毒有关。
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